En el conflicto bélico desatado el 2 de abril de 1982, con el objeto de recuperar la soberanía de las Islas Malvinas, la Prefectura afectó al área (Base Puerto Argentino - Teatro de Operaciones Islas Malvinas) los Guardacostas PNA GC-82 "Islas Malvinas" y GC-83 "Río Iguazú", que cumplieron la hazaña de navegar 600 millas náuticas burlando el bloqueo inglés e incluso evitar el asedio de un submarino nuclear británico detectado durante la travesía.

Habían zarpado desde la dársena "E" del puerto de Buenos Aires el 6 de abril a las 8 horas, actuando en Malvinas desde el 13 de abril al 14 de junio y 22 de mayo respectivamente. Llevaron a cabo, entre otras, las tareas de acompañamiento en navegación a buques de bandera argentina, inteligencia mediante barrido de radar para detectar posibles incursiones enemigas, practicaje de buques nacionales a través de la zona minada en el acceso a Puerto Argentino, apoyo y logística, reconocimiento de la zona Oeste de la isla principal.

Durante el mes de mayo de ese año en tres oportunidades las embarcaciones de la Prefectura Naval Argentina fueron atacadas por las fuerzas inglesas y en una de ellas perdió la vida el Cabo Primero Julio Omar Benitez, tripulante del Guardacostas "Río Iguazú", embarcación que fue hundida como consecuencia del enfrentamiento con un avión Sea Harrier inglés.